2 sa Malý Čepčín nazýval Malými Mošovcami. Približne v roku 1491 sa na tomto panstve usadili mútnianski zemania, z ktorých najrozšírenejšia bola vetva Čepčianskych. Zaujímavý archeologický nález na území Malého Čepčína sa podaril v roku 1872, keď odkryli hrob veľmoža, ktorý bol pochovaný v rakve so železným kovaním, pričom v hrobe bol aj so svojím koňom.
Obyvatelia Malého Čepčína sa od stredoveku zaoberali najmä obchodom s drevom, šindľom a pracovali v poľnohospodárstve. V 19. storočí v obci postavili komposesorátny mlyn, ktorý prenajímali aj spolu s pílou. Od roku 1899 bol v obci matričný úrad, ktorého prvým matrikárom bol Jozef Ráztocký. Obec sa zmenila aj vďaka železnici, aj keď vlastníkom pozemkov sa ich cena pri výkupe nepáčila. V roku 1874 bola v obci postavili jednotriednu budovu štátnej školy. V roku 1888 sa v nej učilo 20 žiakov vo veku od 6 do 12 rokov. K tragickým udalostiam v Malom Čepčíne patrilo najmä vykoľajenie sa vlaku v roku 1895, pri ktorom zahynuli dve osoby, veľký požiar v roku 1877, vznikol na majeri Hrby, ktorý spôsobil vtedy škodu 10 tisíc korún. To bola koncom 19. storočia veľká suma, lebo z archívnych údajov je známe, že obec prispela napríklad na školu v roku 1900 sumou 56 korún a 77 halierov, pretože v roku 1897 sa inšpektor sa sťažoval na zlý technický stav školskej budovy. Malý Čepčín má od roku 1984 kultúrny dom, ktorý v súčasnosti rekonštruujú od roku 1966 materskú školu a z infraštruktúry mu chýba iba kanalizácia.